Gebore in Ozumba, staat van Mexiko, in 1737, het hy 'n godsdienstige loopbaan aangeneem en word hy op twintigjarige ouderdom tot priester georden.
Ondanks sy filosofiese opleiding is hy van jongs af besig met die kennis en toepassing van natuurwetenskappe, fisika, wiskunde en sterrekunde. Hy publiseer waardevolle werke oor wetenskaplike onderwerpe in die koerante en tydskrifte van sy tyd. Hy verwerf internasionale naam en word aangewys as 'n ooreenstemmende vennoot van die Paryse Akademie vir Wetenskap. Hy bestee baie tyd aan wetenskaplike eksperimente en stel 'n groot biblioteek saam. Hy is 'n versamelaar van argeologiese stukke en skaars eksemplare van plante en diere. Verken Xochicalco. Om hom te huldig, is die Antonio Alzate Scientific Society in 1884 gestig, wat in 1935 die Nasionale Akademie vir Wetenskap geword het. Sy bekendste redaksionele werk is die aantekeninge tot die antieke geskiedenis van Mexiko deur die Jesuïet Francisco Javier Clavijero. Daar word gesê dat hy 'n verre familielid van Sor Juana Inés de la Cruz is. Hy is in 1799 in Mexikostad oorlede.
